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專業(yè)的環(huán)保云端知識庫1、astPCR軟件是一個集成工具環(huán)境,提供全面和專業(yè)的設施,可用于設計用于標準,長距離,反向,實時PCR(LUX和自我報告),多重PCR,Xtreme鏈反應(XCR)重疊延伸PCR(OE-PCR)多片段組裝克隆和LAMP(環(huán)介導的等溫擴增);組合特異性(用于遺傳相關DNA序列的通用引物)或獨特(每種遺傳相關DNA序列的特異性引物); 單引物PCR(從緊密定位的反向重復序列設計PCR引物),自動檢測SSR基因座和直接PCR引物設計,氨基酸序列簡并PCR,聚合酶鏈組裝(PCA),設計跨越感興趣的區(qū)域以及更多。
2、用于全基因組或者染色體列表的“ in silico ”(虛擬)PCR引物或探針搜索或者計算機模擬PCR,或者可能的PCR產物的預測以及指定引物或探針的潛在錯配位置的搜索。在一定范圍內同時搜索多個目標! in silico ”寡核苷酸搜索有助于在溫度解鏈和PCR退火溫度計算中發(fā)現目標結合位點。
3、長寡核苷酸可以設計用于微陣列分析和雙標記寡核苷酸用于探針如分子信標。
4、全面的引物測試,標準和簡并寡核苷酸的解鏈溫度計算,引物的PCR效率和語言復雜性,稀釋和重懸計算器。
5、針對所有引物二級結構分析引物(探針),包括與Watson-Crick堿基配對(如G / C-四聯體或搖擺堿基對(如GG,GT,GA),發(fā)夾,自身二聚體和交聯劑)二聚體引物對。該軟件針對所有工具使用正常引物和退化引物的組合,并且熔化溫度計算基于最近鄰熱力學參數。
6、FastPCR具有處理長序列和核酸或蛋白質序列組的能力,并且允許每個給定序列的個體任務和參數以及加入多個不同的任務以進行單次運行。它也允許序列編輯和數據庫分析。
7、通過可視化技術開發(fā)并應用于程序的各種類型重復的高效和完整檢測。
8、該程序包括各種生物信息學工具,用于分析具有GC或AT偏斜,CG%和GA%含量以及嘌呤 - 嘧啶偏斜的序列,語言序列的復雜性; 一代隨機DNA序列,限制性I-II-III型酶和歸巢核酸內切酶分析,尋找或創(chuàng)建編碼序列的限制酶識別位點,支持序列聚類和共有序列的產生以及序列的相似性和保守性分析。
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